Kayseri Eğitim Merkezi 2002 yılında kurulmuştur. Eğitim Merkezinde Hizmet İçi İhtisas, Geliştirme ve İntibak kursları düzenlenmektedir. Geliştirme, mevcut görevlilerin başarı ve verimliliklerini artırmak için; İntibak, aday memurların mesleğe uyumlarını sağlamak ve onları mesleğe hazırlamak için yapılır. Hizmet İçi Eğitim bölümünde D.İ.B.'nda görev yapan İmam-Hatiplerin hizmet öncesi ve hizmet sürecindeki eğitimleri yapılmaktadır.
İhtisas Kursu ise 30 ay süreli bir kurs olup, D.İ.B.'nda görev yapan Vaiz, Murakıp, İmam-Hatip ve Müezzin-Kayyımların İlahiyat Fakültesi eğitiminden sonra sınavla katılmaya hak kazandıkları bir kurstur.
İhtisas kursunun ilk 9 ayı hazırlık, sonraki 21 ayı İhtisas olarak iki safhadan oluşmaktadır. Hazırlık döneminde Arapça dili üzerinde yoğunlaşıp Gramer (Nahv), Kelime Bilgisi (Sarf), Pratik Arapça, Tercüme, Belâgat alanlarında dile hakimiyet amaçlanmaktadır.
İhtisas bölümünde ise Arapça, Tefsir, Hadis ve Fıkıh konularında dersler verilerek kursiyerlerin bu alanlarda uzmanlaşması sağlanmaktadır. Kursiyerler her üç ayda bir, bütün derslerden sınav olmakta ve bu sınavlarda başarılı görülen kursiyerler kursa devam etme hakkına sahip olmaktadırlar.
Ayrıca bu dönemde Kur'an-ı Kerim'in meali yapılarak kursiyerlerin Kur'ân-ı Kerîm'in muhtevasına vâkıf olmaları sağlanmaktadır.
Kayseri Eğitim Merkezi 2005 yılında 51; 2006'da 39; 2007'de 20, 2008'de ise 33 mezun vermiştir. Bu kursu başarıyla tamamlayan kursiyerler, Diyanet İşleri Başkanlığı'nın çeşitli kademelerinde görev almaktadırlar.
Eğitim Merkezinde kursiyerlerin alanlarıyla ilgili istifade edebileceği kaynak eserlerden oluşan bir kütüphane bulunmaktadır.
Kütüphanede kursiyerlere ilmi araştırma yapabilecekleri güzel bir çalışma ortamı sağlanmıştır.
Ayrıca bazı dersler internet üzerinden projeksiyon cihazıyla kütüphanede işlenmektedir.
Eğitim Merkezinde kursiyerlere yönelik farklı alan ve konularda periyodik olarak konferanslar düzenlenmektedir. Konferanslar kendi alanında uzman kişiler tarafından verilmektedir. Bunun yanında Eğitim Merkezine teşrif eden hocalarımız tarafından da farklı zamanlarda konferanslar verilmektedir. Böylece kursiyerlerimiz konulara farklı bakış açılarını kazanmaktadırlar.